براى قدردانى از تلاش هاى علمی و عملی حضرت آیة الله مشکینی قدس سره و زنده نگه داشتن نام و یاد او و نیز فراهم ساختن زمینه بهره ‏بردارى و آگاهى افزون‏تر جامعه علمى و عموم مردم از اندیشه‏ ها و زندگى او، همایش بزرگداشتی در ۲۵ اردیبهشت ۱۳۹۳ در قم و اول خردادماه همان سال در اردبیل برگزار شد. به همین مناسبت، میراث علمى و عملى وى، در چهار مجموعه، با منتشر و در دسترس علاقه مندان قرار گرفت:1. انتشار مجموعه آثار آیة الله مشکینی در 23 عنوان در قالب 50 جلد،2. انتشار بخشی از گفتارهای معظّم له در دو جلد،3. انتشار یادنامۀ آن مرحوم در 6 عنوان در 7 جلد،4. آماده¬سازی و انتشار چند اثر فرهنگی- ترویجی:6-1. نرم¬افزار تلاوت قرآن کریم با ترجمه آیة الله مشکینی (1600 لوح)،6-2. نرم¬افزار مجموعه آثار (2300 نسخه)،6-3. خبرنامه همایش (مجموعاً 3000 نسخه در 3 شماره).آنچه کمیته علمى دربارۀ مجموعه آثار به طور عام انجام داده، به شرح زیر است:۱. تنظیم موضوعى نوشته ‏ها،۲. افزودن حدّ اقلّى از علائم ویرایشى،۳. استخراج مصادر نقل‏ ها،۴. اِعراب‏گذارى حدّ اقلّى متون عربى،۵. اصلاح و تکمیل عناوین،۶. تهیه فهرست فنى.گفتنی است، همایش بزرگداشت آیة الله مشکینی، به همّت مؤسسه حکمت اهل بیت (ع) و همکاری مؤسسه علمی- فرهنگی دارالحدیث انجام شد.مؤسسه حکمت اهل بیت (ع)، در واقع مرکزی برای تنظیم و نشر آثار آیة الله مشکینی است.برنامه¬های آیندۀ این بخش1. تهیه و تکمیل برنامۀ آرشیو دیجیتال آثار مرحوم آیة الله مشکینی2. انجام مقدمات تدوین جلدِ 51 مجموعه آثار و جلدِ 8 یادنامه.3. تبدیل نوارهای کاست درس¬های آن مرحوم به دی وی دی و انجام مقدمات تنظیم و تدوین آن درس¬ها.